维生素B12是一种复杂的有机化合物，可以分为氰钴胺、羟钴胺、腺钴胺和甲钴胺4种维生素。

1、甲钴胺是甲基化的维生素B12，是维生素B12家族之一，但并不是维生素B12，只是两种不同的药；

2、甲钴胺为内源性维生素B12的一种，存在于血液与骨髓中，与其它的维生素B12相比甲钴胺对于神经元的传导具有良好的改善作用，用于治疗神经系统病变时效果优于维生素B12。

3、维生素B12服用以后不能被人体直接利用，维生素B12进入血液循环以后需要转换为甲基钴胺和辅酶B12才采取活性，甲钴胺是不可以经过肝脏代谢，不需要进行生物氧化，可以直接在体内发挥其活性。

4、用法用量的不同。

5、副作用也不同。维生素B12的副作用一般有低血钾和高尿酸血症，甲钴胺副作用一般有皮疹、恶心、呕吐、腹泻等等。